39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1653 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  100 
 
 		 227 aa  463  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  99.12 
 
 		 227 aa  460  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  64.76 
 
 		 218 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  58.41 
 
 		 227 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0964  putative secreted protein  35.41 
 
 		 273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02237  hypothetical protein  34.93 
 
 		 275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.644553  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1652  putative secreted protein  30.52 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1723  hypothetical protein  29.58 
 
 		 285 aa  88.6  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.836094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  27.93 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.18 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  26.15 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  26.09 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  25.11 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  25.11 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  25.11 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  25.11 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  22.65 
 
 		 296 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  27.98 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  27.98 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  23.75 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  23.56 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  23.39 
 
 		 238 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  23.95 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  23.53 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  27.38 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  26.19 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  24.42 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  23.95 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  23.95 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  25.2 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  26.51 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  26.85 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  29.09 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  21.82 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  27.45 
 
 		 319 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  25.97 
 
 		 256 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  23.89 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>