73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2998 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  71.31 
 
 		 238 aa  344  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  71.31 
 
 		 238 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  70.98 
 
 		 238 aa  334  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  71.1 
 
 		 237 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  71.19 
 
 		 237 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  71.1 
 
 		 237 aa  321  8e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  67.66 
 
 		 236 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  67.66 
 
 		 236 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  67.66 
 
 		 236 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  67.23 
 
 		 236 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  36.44 
 
 		 246 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  32.13 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  32.55 
 
 		 319 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  31.48 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  28.81 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  28.51 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  30.14 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  30.36 
 
 		 291 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  30.36 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  28.57 
 
 		 270 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  30.36 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  28.57 
 
 		 270 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  30.36 
 
 		 291 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  27.56 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  27.68 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  28.82 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  27.63 
 
 		 296 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  28.82 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  30.62 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  31.56 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  28.04 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  29.13 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  27.63 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  31.49 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  29.36 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  27.93 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  27.93 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  28.5 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  28.37 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  28.17 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02237  hypothetical protein  27.65 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.644553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  25.91 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  28.65 
 
 		 435 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  28.42 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  28.65 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  27.66 
 
 		 439 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  28.11 
 
 		 426 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  27.66 
 
 		 439 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  27.66 
 
 		 439 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  27.57 
 
 		 460 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  27.13 
 
 		 439 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  27.13 
 
 		 439 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  27.13 
 
 		 439 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  27.13 
 
 		 439 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  27.13 
 
 		 443 aa  52  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  30.77 
 
 		 433 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0964  putative secreted protein  26.18 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  29.46 
 
 		 435 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  26.23 
 
 		 457 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  26.23 
 
 		 427 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  23.16 
 
 		 326 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  25.95 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  28.32 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  26.89 
 
 		 360 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  25.85 
 
 		 404 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  30.18 
 
 		 409 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  25.85 
 
 		 404 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  24.78 
 
 		 344 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  25.26 
 
 		 355 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1723  hypothetical protein  22.39 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.836094  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1652  putative secreted protein  22.11 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4024  hypothetical protein  26.52 
 
 		 258 aa  42  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>