52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0539 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  524  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  93.75 
 
 		 256 aa  494  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  65.97 
 
 		 238 aa  323  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  26.79 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  32.18 
 
 		 236 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  32 
 
 		 236 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  32.18 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  28.02 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  30.81 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  27.73 
 
 		 319 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  27.88 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  31.19 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  26.46 
 
 		 266 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  25.89 
 
 		 291 aa  92.4  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  26.34 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  26.46 
 
 		 263 aa  91.7  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  28.82 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  29.67 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  27.8 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  29.86 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  26.61 
 
 		 270 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  26.61 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  30.14 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  26.15 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  24.67 
 
 		 291 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  24.67 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  24.67 
 
 		 291 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  24.67 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  27.66 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  26.54 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  26.54 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  26.75 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  34.07 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  24.45 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  25.46 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  28.83 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  26.11 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  23.26 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  31.51 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  26 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  27.27 
 
 		 443 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  26.52 
 
 		 439 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  26.52 
 
 		 439 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  26.52 
 
 		 439 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  27.34 
 
 		 435 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  26.52 
 
 		 439 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  26.52 
 
 		 439 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  26.52 
 
 		 439 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  26.52 
 
 		 439 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0598  hypothetical protein  30.21 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  35.94 
 
 		 398 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  27.81 
 
 		 411 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>