17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0598 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0598  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0483  hypothetical protein  27 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.13741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3364  hypothetical protein  26.02 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0661  hypothetical protein  28.22 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0269  hypothetical protein  28.09 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2137  hypothetical protein  26.18 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0542  hypothetical protein  27.69 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3665  hypothetical protein  25.5 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  25.13 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  23.68 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  30.91 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  22.22 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  30.21 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  28.04 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  22 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  31.71 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  27.06 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>