55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2002 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  78 
 
 		 255 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  69 
 
 		 263 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  69.13 
 
 		 261 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  62.75 
 
 		 266 aa  315  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  62.5 
 
 		 296 aa  314  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  65.94 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  65.94 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  65.94 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  65.5 
 
 		 291 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  67.12 
 
 		 270 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  67.12 
 
 		 270 aa  307  8e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  67.57 
 
 		 270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  61.03 
 
 		 319 aa  289  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  57.6 
 
 		 291 aa  266  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  51.57 
 
 		 243 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  31.72 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  29.39 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  31.58 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  30.05 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  29.72 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  28.81 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  29.72 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  27.68 
 
 		 238 aa  99  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  27.23 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  30.69 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  29.13 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  26.34 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  26.89 
 
 		 256 aa  91.7  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  29.13 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  25.89 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  27.54 
 
 		 236 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  27.54 
 
 		 236 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  25.45 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  27.65 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  27.96 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  27.57 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  26.4 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0964  putative secreted protein  27.39 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02237  hypothetical protein  25.88 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.644553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  31.58 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  26.29 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  21.82 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  23.36 
 
 		 227 aa  49.3  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0598  hypothetical protein  25.13 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  22.07 
 
 		 460 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  23.17 
 
 		 398 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  22.52 
 
 		 418 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  22.52 
 
 		 418 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  22.52 
 
 		 435 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  23.19 
 
 		 391 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  21.77 
 
 		 426 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1496  hypothetical protein  24.76 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  24.68 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  29.41 
 
 		 411 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>