42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3198 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  508  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  35.81 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  34.1 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  30.32 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  27.2 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  30.69 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  29.7 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  31.16 
 
 		 238 aa  89  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  29.19 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  26.61 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  29.08 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  29.11 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  31.94 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  29.84 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  27.91 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  29.84 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  27.91 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  30.05 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  29.05 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  29.32 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  27.44 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  29.84 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  29.56 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  29.56 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  29.56 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  29.32 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  29.32 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  29.32 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  31.13 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  28.27 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  28.51 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  26.09 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  25.32 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  25.98 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  25.13 
 
 		 326 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  24.41 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  25.81 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  26.07 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  23.83 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  29.66 
 
 		 396 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  23.56 
 
 		 411 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>