63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1698 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  96.62 
 
 		 237 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  84.81 
 
 		 237 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  82.03 
 
 		 236 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  81.11 
 
 		 236 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  81.11 
 
 		 236 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  80.65 
 
 		 236 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  70.76 
 
 		 238 aa  342  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  66.24 
 
 		 238 aa  321  7e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  66.53 
 
 		 238 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  63.47 
 
 		 238 aa  292  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  36.28 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  32.31 
 
 		 246 aa  128  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  35.05 
 
 		 319 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  32.21 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  32.54 
 
 		 270 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  32.54 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  28.95 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  31.58 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  30.67 
 
 		 255 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  30.63 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  30.57 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  31 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  31.25 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  31.25 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  31.25 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  31.25 
 
 		 291 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  32.11 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  29.91 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  27.54 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  29.46 
 
 		 256 aa  92  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.4 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  31.25 
 
 		 238 aa  85.9  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  32.48 
 
 		 244 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  29.47 
 
 		 291 aa  85.5  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  28.76 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  28.64 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  28.21 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  27.32 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  27.32 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  27.87 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  27.48 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02237  hypothetical protein  26.94 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.644553  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  27.81 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  26.49 
 
 		 326 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  26.13 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1652  putative secreted protein  22.48 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  25.74 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1723  hypothetical protein  21.3 
 
 		 285 aa  45.4  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.836094  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  24.88 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  25.23 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  25.28 
 
 		 427 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  25.28 
 
 		 457 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  25.41 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  25.41 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  25.41 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  30.23 
 
 		 439 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  26.73 
 
 		 435 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  30.23 
 
 		 439 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  30.23 
 
 		 439 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  30.23 
 
 		 439 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0598  hypothetical protein  24.88 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0964  putative secreted protein  23.41 
 
 		 273 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>