16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1723 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1723  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  588  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.836094  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1652  putative secreted protein  97.89 
 
 
285 aa  551  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02237  hypothetical protein  63.64 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.644553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0964  putative secreted protein  59.31 
 
 
273 aa  297  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.15693 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  32.16 
 
 
227 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  29.47 
 
 
218 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  29.58 
 
 
227 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  29.58 
 
 
227 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  24.62 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  23.38 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  21.3 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  20.63 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  23.79 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  21.43 
 
 
237 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  24.23 
 
 
238 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  23.42 
 
 
255 aa  42.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>