65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1261 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  98.31 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  97.46 
 
 		 236 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  97.03 
 
 		 236 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  79.75 
 
 		 237 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3691  hypothetical protein  81 
 
 		 237 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  81 
 
 		 237 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  66.95 
 
 		 238 aa  332  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4566  hypothetical protein  65.53 
 
 		 238 aa  321  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52060  hypothetical protein  65.11 
 
 		 238 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  65.61 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0944  hypothetical protein  37.55 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2810  hypothetical protein  33.48 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0551  hypothetical protein  33.03 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1871  hypothetical protein  34.11 
 
 		 319 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0539  hypothetical protein  32.11 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296961 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2533  hypothetical protein  27.66 
 
 		 266 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2321  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000333934  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2601  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0731507  normal  0.648058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2002  hypothetical protein  26.64 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.50743  hitchhiker  0.00000157638 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2144  hypothetical protein  27.83 
 
 		 270 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177211  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2221  hypothetical protein  27.83 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0258395  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1793  hypothetical protein  27.63 
 
 		 296 aa  85.9  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0380708  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0633  hypothetical protein  30.45 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  34.44 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2491  hypothetical protein  30.32 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000306277  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1378  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.1 
 
 		 259 aa  85.5  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2069  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0449717  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2317  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000551185  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2304  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000385954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2106  hypothetical protein  26.22 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00209311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02150  hypothetical protein  28.9 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1868  hypothetical protein  26.73 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1766  hypothetical protein  25.6 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000274538  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  26.92 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3198  hypothetical protein  29.19 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00837868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0963  hypothetical protein  30.17 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1653  putative secreted protein  28.57 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1724  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.614731  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  28.76 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02236  hypothetical protein  27.01 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2255  hypothetical protein  29.01 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.572802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  29.19 
 
 		 326 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  25.61 
 
 		 360 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  27.14 
 
 		 324 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02237  hypothetical protein  26.56 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.644553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  25.86 
 
 		 457 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  25.86 
 
 		 427 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  28.12 
 
 		 344 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  24.71 
 
 		 439 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  24.48 
 
 		 418 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  26.29 
 
 		 435 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  25 
 
 		 418 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  24.71 
 
 		 439 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  24.71 
 
 		 439 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  24.71 
 
 		 426 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  27.46 
 
 		 409 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  22.78 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  29.06 
 
 		 439 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  29.06 
 
 		 439 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  29.06 
 
 		 439 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  29.06 
 
 		 439 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  27.64 
 
 		 355 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  25.86 
 
 		 460 aa  41.6  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>