40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3160 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1825  hypothetical protein  32.38 
 
 		 245 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  36.02 
 
 		 352 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0206  hypothetical protein  35.36 
 
 		 231 aa  97.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.300628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2619  hypothetical protein  28.24 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  35.29 
 
 		 175 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  29.55 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  27.62 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  27.67 
 
 		 435 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  25.55 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  32.97 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2665  hypothetical protein  27.75 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  25.33 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  28.3 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  25.33 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  25.47 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1663  hypothetical protein  27.14 
 
 		 236 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  23.74 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  27.14 
 
 		 236 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  26.79 
 
 		 393 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1261  hypothetical protein  27.14 
 
 		 236 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  27 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  30.83 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4055  hypothetical protein  24.52 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  26.42 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0265  hypothetical protein  24.76 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0299204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  30.33 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  26.67 
 
 		 357 aa  46.2  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  25.51 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  26.8 
 
 		 439 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  26.8 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  26.8 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  27.84 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  26.8 
 
 		 439 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  26.8 
 
 		 439 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  26.8 
 
 		 439 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  26.8 
 
 		 439 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1698  hypothetical protein  24.88 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  30 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1631  hypothetical protein  25.82 
 
 		 237 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>