32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0265 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0265  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  776    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0299204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  54.5 
 
 		 401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  31.7 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  30.49 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  32.89 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  32.58 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  29.87 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  28 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  28 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  29.41 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  29.86 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  28.17 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  29.03 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  27.34 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  27.35 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  30.14 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  30.14 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  30.14 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  30.14 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  27.96 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  26.64 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  28.27 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  27.07 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  25.21 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  25.67 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  27.78 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  24.41 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  26.67 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3265  hypothetical protein  27.4 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  25 
 
 		 344 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0206  hypothetical protein  21.7 
 
 		 231 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.300628 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  24.19 
 
 		 266 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>