37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0595 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  772    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0265  hypothetical protein  54.5 
 
 
400 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0299204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  30.43 
 
 
393 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  32.43 
 
 
404 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  32.43 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  30.49 
 
 
396 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  32.58 
 
 
231 aa  97.1  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  33.64 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  29.2 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  30 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  29.21 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  30.53 
 
 
460 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  32.06 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  29.41 
 
 
457 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  28.12 
 
 
443 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  26.67 
 
 
360 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  28.44 
 
 
418 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  30.86 
 
 
344 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  28.44 
 
 
418 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  28.12 
 
 
439 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  28.44 
 
 
427 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  27.98 
 
 
435 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  28 
 
 
426 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  28.12 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  28.12 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  28.12 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  28.12 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  28.12 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  28.12 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3265  hypothetical protein  29.56 
 
 
377 aa  56.6  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  28.85 
 
 
409 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  26.28 
 
 
324 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  27.05 
 
 
433 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0206  hypothetical protein  24.39 
 
 
231 aa  50.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.300628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  26.57 
 
 
435 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  30.22 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  23.83 
 
 
324 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>