42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0961 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  661    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  38.57 
 
 		 439 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  38.57 
 
 		 439 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  38.57 
 
 		 439 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  38.57 
 
 		 439 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  38.57 
 
 		 439 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  38.57 
 
 		 439 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  38.57 
 
 		 439 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  38.57 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  37.18 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  35 
 
 		 457 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  35 
 
 		 427 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  36.07 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  34.7 
 
 		 418 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  34.7 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  34.7 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  35.62 
 
 		 433 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  34.7 
 
 		 426 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  33.64 
 
 		 460 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  36.28 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  35.4 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  34.22 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  31.22 
 
 		 326 aa  95.9  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  30.18 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0888  hypothetical protein  61.67 
 
 		 65 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.201021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  28.93 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  25.81 
 
 		 404 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  28.44 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  25.81 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  28.5 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0887  hypothetical protein  58.73 
 
 		 62 aa  70.5  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3265  hypothetical protein  28.57 
 
 		 377 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  31.49 
 
 		 175 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  27.75 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  27.43 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  26.07 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  28.08 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  24.45 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  26.34 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1825  hypothetical protein  25.91 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0171796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  23.83 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0206  hypothetical protein  23.61 
 
 		 231 aa  46.2  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.300628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>