35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2665 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2665  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  475  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0206  hypothetical protein  32.09 
 
 
231 aa  109  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.300628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2619  hypothetical protein  31.49 
 
 
254 aa  99.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1825  hypothetical protein  31.1 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  30.39 
 
 
352 aa  72.4  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  28.7 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  30.57 
 
 
391 aa  62.4  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  27.75 
 
 
324 aa  58.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  27.43 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  26.05 
 
 
326 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  27.75 
 
 
396 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  26.13 
 
 
344 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  26.82 
 
 
393 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  28.73 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  22.77 
 
 
360 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  28.17 
 
 
443 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  27.8 
 
 
439 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  27.8 
 
 
439 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  27.8 
 
 
439 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  27.8 
 
 
439 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  23.85 
 
 
334 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  27.8 
 
 
439 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  27.95 
 
 
439 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  27.8 
 
 
439 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  28.57 
 
 
404 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  26.91 
 
 
409 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  28.57 
 
 
404 aa  45.4  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  27.33 
 
 
398 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  26.27 
 
 
355 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0712  hypothetical protein  22.58 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.63892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  25.45 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  24.9 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0551  hypothetical protein  27.48 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.658298  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  29.07 
 
 
411 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  24.9 
 
 
252 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>