35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0881 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  521  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  94.09 
 
 		 252 aa  490  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2822  hypothetical protein  45.98 
 
 		 254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3899  hypothetical protein  42.26 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3984  hypothetical protein  41.84 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000089502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2836  hypothetical protein  40.79 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000912269  hitchhiker  6.77767e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1036  hypothetical protein  43.32 
 
 		 190 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0673  hypothetical protein  38.89 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00610993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0990  hypothetical protein  35.59 
 
 		 386 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0868  hypothetical protein  32.41 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3378  hypothetical protein  31.92 
 
 		 387 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2728  hypothetical protein  29.65 
 
 		 378 aa  95.5  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0901  hypothetical protein  31.72 
 
 		 370 aa  92.8  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1556  hypothetical protein  24.65 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0730  hypothetical protein  25.2 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02605  hypothetical protein  26.99 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4723  hypothetical protein  27.31 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.463403 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0308  hypothetical protein  25.2 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4024  hypothetical protein  24.31 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1245  hypothetical protein  25.82 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3044  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.461532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2506  hypothetical protein  26.32 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196363  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1445  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1348  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1361  hypothetical protein  28.04 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0159506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0003  hypothetical protein  25.1 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0221782  normal  0.0594362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0008  hypothetical protein  21.84 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000051301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2504  hypothetical protein  30.7 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3145  hypothetical protein  23.14 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0144664  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1342  hypothetical protein  24.62 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4124  hypothetical protein  24.78 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0322703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1350  hypothetical protein  28.07 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1447  hypothetical protein  28.07 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1363  hypothetical protein  27.43 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2665  hypothetical protein  24.9 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>