31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0673 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0673  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00610993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2836  hypothetical protein  78.54 
 
 		 237 aa  347  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000912269  hitchhiker  6.77767e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1036  hypothetical protein  61.58 
 
 		 190 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2822  hypothetical protein  40.18 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  36.63 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  36.21 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3984  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000089502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0990  hypothetical protein  35.35 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1556  hypothetical protein  30.05 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3378  hypothetical protein  32.87 
 
 		 387 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2728  hypothetical protein  31.22 
 
 		 378 aa  89.4  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4723  hypothetical protein  26.94 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.463403 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0901  hypothetical protein  30.61 
 
 		 370 aa  78.6  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001496 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1350  hypothetical protein  25.7 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0730  hypothetical protein  22.76 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1447  hypothetical protein  25.7 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0308  hypothetical protein  24.31 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02605  hypothetical protein  25.27 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1245  hypothetical protein  24.36 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4024  hypothetical protein  23.53 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2504  hypothetical protein  23.83 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1363  hypothetical protein  25.23 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3145  hypothetical protein  25.78 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0144664  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4124  hypothetical protein  25.74 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0322703 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1342  hypothetical protein  24.14 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3044  hypothetical protein  25.52 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.461532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0003  hypothetical protein  20.39 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0221782  normal  0.0594362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0008  hypothetical protein  21.19 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000051301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2619  hypothetical protein  27.81 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>