32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02605 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02605  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  628  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0730  hypothetical protein  50.79 
 
 
257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0308  hypothetical protein  44.66 
 
 
263 aa  221  9e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4024  hypothetical protein  35.15 
 
 
258 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0003  hypothetical protein  34.21 
 
 
268 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0221782  normal  0.0594362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0008  hypothetical protein  32.57 
 
 
263 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000051301  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1245  hypothetical protein  30.63 
 
 
264 aa  155  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1342  hypothetical protein  34.26 
 
 
284 aa  143  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3044  hypothetical protein  30 
 
 
273 aa  133  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.461532  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2822  hypothetical protein  27.75 
 
 
254 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701017  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0901  hypothetical protein  26.2 
 
 
370 aa  87.8  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2836  hypothetical protein  24.15 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000912269  hitchhiker  6.77767e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  27.88 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1036  hypothetical protein  26.7 
 
 
190 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  26.99 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1556  hypothetical protein  23.32 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.285597  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3984  hypothetical protein  26.64 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000089502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0673  hypothetical protein  25.27 
 
 
247 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00610993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3899  hypothetical protein  26.15 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4124  hypothetical protein  24.36 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2504  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2728  hypothetical protein  24.66 
 
 
378 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1447  hypothetical protein  24.46 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1350  hypothetical protein  24.46 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0868  hypothetical protein  29.63 
 
 
388 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3378  hypothetical protein  28.7 
 
 
387 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3145  hypothetical protein  21.51 
 
 
284 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0144664  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4723  hypothetical protein  20.97 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.463403 
 
 
-
 
NC_002950  PG1083  hypothetical protein  22.14 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.227893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0990  hypothetical protein  28.04 
 
 
386 aa  55.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413013  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1363  hypothetical protein  27.46 
 
 
281 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106817  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1361  hypothetical protein  19.07 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0159506  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>