21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3145 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3145  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  578  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0144664  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2836  hypothetical protein  25.1 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000912269  hitchhiker  6.77767e-17 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0901  hypothetical protein  27.31 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1036  hypothetical protein  28.85 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0308  hypothetical protein  24.42 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1245  hypothetical protein  22.05 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0673  hypothetical protein  25.78 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00610993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2822  hypothetical protein  26.42 
 
 
254 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  23.69 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02605  hypothetical protein  20.83 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  22.89 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0730  hypothetical protein  20.9 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3378  hypothetical protein  30.7 
 
 
387 aa  45.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637461  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2504  hypothetical protein  28.7 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1350  hypothetical protein  28.7 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1447  hypothetical protein  28.7 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0868  hypothetical protein  31.58 
 
 
388 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4124  hypothetical protein  27.34 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3984  hypothetical protein  20.36 
 
 
236 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000089502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0990  hypothetical protein  31.36 
 
 
386 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413013  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3044  hypothetical protein  25 
 
 
273 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.461532  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>