30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2836 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2836  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000912269  hitchhiker  6.77767e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0673  hypothetical protein  78.54 
 
 
247 aa  346  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00610993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1036  hypothetical protein  61.96 
 
 
190 aa  228  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  40.79 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  39.91 
 
 
252 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2822  hypothetical protein  40.47 
 
 
254 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3899  hypothetical protein  32.31 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3984  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000089502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0990  hypothetical protein  35.05 
 
 
386 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0868  hypothetical protein  32.56 
 
 
388 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3378  hypothetical protein  32.09 
 
 
387 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2728  hypothetical protein  34.1 
 
 
378 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1556  hypothetical protein  28.31 
 
 
258 aa  99.8  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.285597  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0901  hypothetical protein  28.83 
 
 
370 aa  90.9  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0730  hypothetical protein  25.11 
 
 
257 aa  85.1  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02605  hypothetical protein  24.15 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0308  hypothetical protein  22.18 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1350  hypothetical protein  27.9 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1447  hypothetical protein  27.9 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1245  hypothetical protein  24.78 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4723  hypothetical protein  26.48 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.463403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2504  hypothetical protein  27.47 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3145  hypothetical protein  25.88 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0144664  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1363  hypothetical protein  31.13 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106817  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4024  hypothetical protein  22.17 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3044  hypothetical protein  24.8 
 
 
273 aa  65.1  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.461532  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4124  hypothetical protein  27.59 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322703 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1342  hypothetical protein  23.71 
 
 
284 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0003  hypothetical protein  20.41 
 
 
268 aa  52.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0221782  normal  0.0594362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0008  hypothetical protein  20.42 
 
 
263 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000051301  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>