31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1447 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1350  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1447  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2504  hypothetical protein  96.79 
 
 
249 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1363  hypothetical protein  75.89 
 
 
281 aa  362  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106817  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4124  hypothetical protein  58.82 
 
 
283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0673  hypothetical protein  25.7 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00610993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2836  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000912269  hitchhiker  6.77767e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2822  hypothetical protein  27.73 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1556  hypothetical protein  26.58 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.285597  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0901  hypothetical protein  28.57 
 
 
370 aa  65.9  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0003  hypothetical protein  22.81 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0221782  normal  0.0594362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3044  hypothetical protein  23.55 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.461532  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4024  hypothetical protein  25 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1036  hypothetical protein  27.91 
 
 
190 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1445  hypothetical protein  28.19 
 
 
262 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1348  hypothetical protein  28 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02605  hypothetical protein  24.69 
 
 
307 aa  55.5  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  26.4 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  26.53 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0730  hypothetical protein  22.62 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2506  hypothetical protein  27.11 
 
 
262 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4723  hypothetical protein  25.58 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.463403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0008  hypothetical protein  24.1 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000051301  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1361  hypothetical protein  27.56 
 
 
253 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0159506  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3145  hypothetical protein  28.7 
 
 
284 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0144664  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0308  hypothetical protein  23.35 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1245  hypothetical protein  22.69 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0990  hypothetical protein  28.21 
 
 
386 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2021  hypothetical protein  20.52 
 
 
291 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000598222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2391  hypothetical protein  23.53 
 
 
261 aa  42  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.568212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3984  hypothetical protein  25.71 
 
 
236 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000089502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>