25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0990 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0990  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  787    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0868  hypothetical protein  59.89 
 
 
388 aa  431  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3378  hypothetical protein  57.75 
 
 
387 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2728  hypothetical protein  57.39 
 
 
378 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2822  hypothetical protein  39.63 
 
 
254 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  35.59 
 
 
254 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2836  hypothetical protein  35.05 
 
 
237 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000912269  hitchhiker  6.77767e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  35.14 
 
 
252 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0673  hypothetical protein  35.02 
 
 
247 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00610993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1036  hypothetical protein  37.3 
 
 
190 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3984  hypothetical protein  29.91 
 
 
236 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000089502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3899  hypothetical protein  29.52 
 
 
260 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1556  hypothetical protein  27.98 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.285597  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0901  hypothetical protein  38.1 
 
 
370 aa  79.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0730  hypothetical protein  24.77 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0308  hypothetical protein  30.65 
 
 
263 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4723  hypothetical protein  23.72 
 
 
270 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.463403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4024  hypothetical protein  28.32 
 
 
258 aa  59.7  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02605  hypothetical protein  28.3 
 
 
307 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3044  hypothetical protein  29.41 
 
 
273 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.461532  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0003  hypothetical protein  26.53 
 
 
268 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0221782  normal  0.0594362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1363  hypothetical protein  24.09 
 
 
281 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106817  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4124  hypothetical protein  28.8 
 
 
283 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1350  hypothetical protein  28.21 
 
 
249 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1447  hypothetical protein  28.21 
 
 
249 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>