24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2728 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2728  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  750    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0868  hypothetical protein  45.38 
 
 		 388 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3378  hypothetical protein  45.01 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0990  hypothetical protein  51.07 
 
 		 386 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413013  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2822  hypothetical protein  35.81 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2836  hypothetical protein  34.1 
 
 		 237 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000912269  hitchhiker  6.77767e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  29.65 
 
 		 254 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1036  hypothetical protein  33.15 
 
 		 190 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  29.2 
 
 		 252 aa  90.9  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0673  hypothetical protein  31.22 
 
 		 247 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00610993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0730  hypothetical protein  30.56 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0901  hypothetical protein  27.87 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1556  hypothetical protein  29.65 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3984  hypothetical protein  28.63 
 
 		 236 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000089502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3899  hypothetical protein  28.19 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4024  hypothetical protein  29.66 
 
 		 258 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0308  hypothetical protein  32.71 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02605  hypothetical protein  27.36 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1245  hypothetical protein  24.07 
 
 		 264 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3044  hypothetical protein  24.77 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.461532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1363  hypothetical protein  27.16 
 
 		 281 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4723  hypothetical protein  23.96 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.463403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0008  hypothetical protein  25.23 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000051301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0003  hypothetical protein  21.95 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0221782  normal  0.0594362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>