28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3378 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3378  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  783    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0868  hypothetical protein  77.27 
 
 		 388 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0990  hypothetical protein  57.75 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2728  hypothetical protein  43 
 
 		 378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2822  hypothetical protein  33.64 
 
 		 254 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2836  hypothetical protein  32.09 
 
 		 237 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000912269  hitchhiker  6.77767e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  31.92 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0673  hypothetical protein  32.87 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00610993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  31.65 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1036  hypothetical protein  33.68 
 
 		 190 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3984  hypothetical protein  30.48 
 
 		 236 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000089502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3899  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1556  hypothetical protein  29.02 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0730  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0901  hypothetical protein  29.52 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001496 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4024  hypothetical protein  24.07 
 
 		 258 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3044  hypothetical protein  27.11 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.461532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4723  hypothetical protein  23.36 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.463403 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0308  hypothetical protein  27.42 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02605  hypothetical protein  28.7 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1245  hypothetical protein  26.92 
 
 		 264 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1363  hypothetical protein  22.22 
 
 		 281 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0003  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0221782  normal  0.0594362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0008  hypothetical protein  29.91 
 
 		 263 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000051301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3145  hypothetical protein  30.7 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0144664  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2504  hypothetical protein  21.23 
 
 		 249 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4124  hypothetical protein  27.01 
 
 		 283 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0322703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3010  hypothetical protein  23.56 
 
 		 218 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.234165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>