31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0008 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0008  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  541  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000051301  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0003  hypothetical protein  56.3 
 
 
268 aa  299  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0221782  normal  0.0594362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3044  hypothetical protein  40.89 
 
 
273 aa  229  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.461532  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1342  hypothetical protein  36.94 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4024  hypothetical protein  34.23 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1245  hypothetical protein  34.65 
 
 
264 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0730  hypothetical protein  32.95 
 
 
257 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02605  hypothetical protein  34.33 
 
 
307 aa  148  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0308  hypothetical protein  32.46 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0901  hypothetical protein  26.82 
 
 
370 aa  94.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4723  hypothetical protein  21.76 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.463403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4124  hypothetical protein  25.78 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1556  hypothetical protein  23.32 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.285597  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2822  hypothetical protein  21.1 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701017  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1083  hypothetical protein  22.47 
 
 
313 aa  63.5  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.227893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1363  hypothetical protein  25.22 
 
 
281 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106817  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  21.84 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1036  hypothetical protein  22.15 
 
 
190 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3899  hypothetical protein  22.98 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  21.15 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3984  hypothetical protein  22.32 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000089502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1350  hypothetical protein  23.81 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1447  hypothetical protein  23.81 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2504  hypothetical protein  23.81 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3378  hypothetical protein  29.91 
 
 
387 aa  48.9  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0868  hypothetical protein  31.48 
 
 
388 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0673  hypothetical protein  21.19 
 
 
247 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00610993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2836  hypothetical protein  20.42 
 
 
237 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000912269  hitchhiker  6.77767e-17 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1361  hypothetical protein  20.86 
 
 
253 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0159506  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2728  hypothetical protein  25.23 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0990  hypothetical protein  24.31 
 
 
386 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>