39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1556 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1556  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  530  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.285597  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0673  hypothetical protein  29.87 
 
 
247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00610993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2836  hypothetical protein  28.81 
 
 
237 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000912269  hitchhiker  6.77767e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2822  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  25.51 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  25.1 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0901  hypothetical protein  26.78 
 
 
370 aa  89.7  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0990  hypothetical protein  27.93 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3984  hypothetical protein  27.07 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000089502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3899  hypothetical protein  26.4 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4723  hypothetical protein  25.35 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.463403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3378  hypothetical protein  29.03 
 
 
387 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2728  hypothetical protein  29.31 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02605  hypothetical protein  22.59 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0868  hypothetical protein  27.65 
 
 
388 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0730  hypothetical protein  21.95 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0003  hypothetical protein  22.32 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0221782  normal  0.0594362 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0308  hypothetical protein  23.95 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1036  hypothetical protein  25.28 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1350  hypothetical protein  26.84 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1447  hypothetical protein  26.84 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2504  hypothetical protein  26.41 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3044  hypothetical protein  23.08 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.461532  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0008  hypothetical protein  23.32 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000051301  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1245  hypothetical protein  24.56 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1363  hypothetical protein  26.99 
 
 
281 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106817  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4124  hypothetical protein  21.97 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322703 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4024  hypothetical protein  23.44 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1361  hypothetical protein  27.07 
 
 
253 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0159506  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2619  hypothetical protein  27.89 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1445  hypothetical protein  31.86 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1348  hypothetical protein  31.86 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2506  hypothetical protein  30.83 
 
 
262 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196363  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  27.71 
 
 
360 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  29.38 
 
 
344 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2639  hypothetical protein  23.36 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3078  hypothetical protein  29.32 
 
 
255 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1342  hypothetical protein  20.96 
 
 
284 aa  42.4  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2555  putative signal peptide protein  26.74 
 
 
258 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>