32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3984 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3984  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  484  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000089502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3899  hypothetical protein  94.92 
 
 
260 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  41.42 
 
 
252 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  41.84 
 
 
254 aa  198  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2822  hypothetical protein  35.05 
 
 
254 aa  151  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0673  hypothetical protein  34.4 
 
 
247 aa  122  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00610993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2836  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000912269  hitchhiker  6.77767e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1036  hypothetical protein  35.52 
 
 
190 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0868  hypothetical protein  30 
 
 
388 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3378  hypothetical protein  30.48 
 
 
387 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0990  hypothetical protein  29.91 
 
 
386 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413013  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4723  hypothetical protein  25.59 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.463403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0730  hypothetical protein  27.98 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1245  hypothetical protein  25.35 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1556  hypothetical protein  26.24 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.285597  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3044  hypothetical protein  27.16 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.461532  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2728  hypothetical protein  28.7 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0308  hypothetical protein  25.73 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4024  hypothetical protein  23.5 
 
 
258 aa  71.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02605  hypothetical protein  26.97 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1348  hypothetical protein  32.35 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1445  hypothetical protein  32.35 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2506  hypothetical protein  31.37 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196363  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0901  hypothetical protein  27.52 
 
 
370 aa  65.5  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001496 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1361  hypothetical protein  30.84 
 
 
253 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0159506  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4124  hypothetical protein  32.04 
 
 
283 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0003  hypothetical protein  23.01 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0221782  normal  0.0594362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2619  hypothetical protein  26.8 
 
 
254 aa  58.5  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0008  hypothetical protein  22.32 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000051301  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1342  hypothetical protein  22.37 
 
 
284 aa  47  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2504  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1363  hypothetical protein  26.73 
 
 
281 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>