30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3899 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3899  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3984  hypothetical protein  94.92 
 
 		 236 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000089502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3379  hypothetical protein  41.84 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0881  hypothetical protein  42.26 
 
 		 254 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2822  hypothetical protein  35.21 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0673  hypothetical protein  34.4 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00610993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2836  hypothetical protein  32.31 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000912269  hitchhiker  6.77767e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1036  hypothetical protein  34.97 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0868  hypothetical protein  29.52 
 
 		 388 aa  89.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0990  hypothetical protein  30.37 
 
 		 386 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3378  hypothetical protein  30 
 
 		 387 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0730  hypothetical protein  28.81 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4723  hypothetical protein  24.17 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.463403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1245  hypothetical protein  25.81 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0308  hypothetical protein  26.61 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1556  hypothetical protein  25.79 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3044  hypothetical protein  25.97 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.461532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4024  hypothetical protein  23.5 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2728  hypothetical protein  28.25 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02605  hypothetical protein  26.15 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1445  hypothetical protein  31.37 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1348  hypothetical protein  31.37 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2506  hypothetical protein  30.39 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196363  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0901  hypothetical protein  22.69 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0003  hypothetical protein  23.45 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0221782  normal  0.0594362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1361  hypothetical protein  28.97 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0159506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4124  hypothetical protein  32.65 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0322703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0008  hypothetical protein  22.98 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000051301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2619  hypothetical protein  26 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1342  hypothetical protein  22.81 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>