33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2555 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2555  putative signal peptide protein  100 
 
 		 258 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3585  hypothetical protein  52.74 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3878  hypothetical protein  52.94 
 
 		 260 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0512827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4040  hypothetical protein  44.84 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0919  hypothetical protein  38.34 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2016  hypothetical protein  37.9 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.915492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1940  hypothetical protein  37.9 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3078  hypothetical protein  34.03 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4859  hypothetical protein  33.88 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4396  hypothetical protein  33.88 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4907  hypothetical protein  32.32 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.904735  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0493  hypothetical protein  32.11 
 
 		 290 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0407  hypothetical protein  32.28 
 
 		 289 aa  126  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3702  hypothetical protein  30.6 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0282  hypothetical protein  30.94 
 
 		 293 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108801 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0547  hypothetical protein  32.33 
 
 		 296 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7547  hypothetical protein  30.12 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1938  hypothetical protein  28.63 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  0.0147778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3666  hypothetical protein  32.33 
 
 		 287 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0503  hypothetical protein  29.15 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4517  hypothetical protein  30.47 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0243839  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0544  hypothetical protein  28.63 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0172  hypothetical protein  30.21 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4587  hypothetical protein  29.51 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428092  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3592  hypothetical protein  28.21 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1857  hypothetical protein  25.54 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1704  hypothetical protein  28.32 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.624159  normal  0.112956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2291  hypothetical protein  26.89 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.429146  normal  0.89015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2639  hypothetical protein  26.36 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2014  hypothetical protein  29.65 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0724  hypothetical protein  29.65 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188626  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3112  hypothetical protein  25.54 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  hitchhiker  0.00759909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2581  hypothetical protein  24.53 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132118  hitchhiker  0.00012432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>