More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0010 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  555  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  57.99 
 
 		 269 aa  327  9e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  57.62 
 
 		 269 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  31.02 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  32.97 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  30.37 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  30.37 
 
 		 269 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 269 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  31.48 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.8 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  30.71 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  28.16 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  27.18 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  28.67 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  24.48 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  27.82 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  28.16 
 
 		 272 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  24.15 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  30.71 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  28.93 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  28.2 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  26.16 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  25.64 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  26.81 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  26.48 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  29.64 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  30.96 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  24.36 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  24.38 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2581  transcriptional regulator, putative  25.35 
 
 		 212 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0799223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  29.64 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  22.68 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  24.29 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  32.37 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  23.13 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  27.49 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  25.18 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  24.54 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  24.57 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  24.37 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  22.71 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  37.11 
 
 		 398 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.53 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  26.62 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1352  transcriptional regulator, MerR family  21.99 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0877122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 161 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  42.86 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  40.7 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  31.67 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  36.46 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  35.24 
 
 		 177 aa  62  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  32 
 
 		 253 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  39.77 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  37.36 
 
 		 191 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  31.73 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  28.83 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>