69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2339 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  416  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  98.56 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  98.56 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  65.24 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 208 aa  242  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 236 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3278  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 269 aa  48.1  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 243 aa  48.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 220 aa  42  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 203 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 204 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 231 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 193 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  28.38 
 
 		 223 aa  41.2  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 221 aa  41.2  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>