More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1460 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1460  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
399 aa  820    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  62.31 
 
 
392 aa  498  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  55.5 
 
 
391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  48.84 
 
 
397 aa  388  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  48.84 
 
 
401 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 
393 aa  347  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  43.3 
 
 
396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 
394 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  45.22 
 
 
394 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  39.95 
 
 
395 aa  311  9e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  46.76 
 
 
388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  36.84 
 
 
400 aa  291  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 
383 aa  282  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.21 
 
 
393 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  39.65 
 
 
405 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
395 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.14 
 
 
404 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
395 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  39.14 
 
 
406 aa  276  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.69 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
393 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  38.4 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  37.95 
 
 
393 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  40.05 
 
 
402 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
393 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.95 
 
 
393 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.21 
 
 
393 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.21 
 
 
393 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.21 
 
 
393 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.21 
 
 
393 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.21 
 
 
393 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
398 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.21 
 
 
393 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  39.79 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  38.13 
 
 
395 aa  270  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  36.92 
 
 
398 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 
397 aa  270  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
395 aa  267  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 
398 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  38.05 
 
 
406 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
393 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 
393 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 
393 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
406 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  36.86 
 
 
417 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 
407 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 
386 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  35.03 
 
 
397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 
396 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 
396 aa  259  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.84 
 
 
406 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
397 aa  254  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
426 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  39.38 
 
 
402 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 
426 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  34.94 
 
 
395 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
398 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  38.9 
 
 
450 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
340 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  34.94 
 
 
400 aa  249  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  35.86 
 
 
397 aa  248  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
414 aa  249  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  37.66 
 
 
420 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  37.67 
 
 
416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  39.41 
 
 
400 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  36.34 
 
 
377 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
398 aa  243  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  34.77 
 
 
396 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
395 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 
400 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
393 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.83 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
426 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  40.53 
 
 
402 aa  235  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  35.29 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  35.01 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 
394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  35.5 
 
 
404 aa  232  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  35.28 
 
 
405 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
397 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 
440 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 
394 aa  230  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 
441 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  34.25 
 
 
433 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 
404 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 
390 aa  226  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
401 aa  226  6e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 
396 aa  226  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 
463 aa  225  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
401 aa  224  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 
430 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 
396 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  34.44 
 
 
416 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>