174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2104 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
483 aa  1003    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  66.38 
 
 
479 aa  643    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  74.43 
 
 
485 aa  760    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  66.88 
 
 
479 aa  642    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  73.5 
 
 
491 aa  758    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  67.03 
 
 
479 aa  649    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  70.88 
 
 
481 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  63.64 
 
 
791 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  63.79 
 
 
791 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  57.91 
 
 
844 aa  570  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  62.59 
 
 
791 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  63.11 
 
 
810 aa  565  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  66.26 
 
 
413 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  62.56 
 
 
777 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  38.63 
 
 
775 aa  304  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  41.18 
 
 
345 aa  281  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  40.78 
 
 
343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  41.71 
 
 
343 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  40.39 
 
 
359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  39.24 
 
 
358 aa  263  6.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  40.98 
 
 
389 aa  253  5.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  30.66 
 
 
324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  29.71 
 
 
318 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  30.68 
 
 
313 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  28.61 
 
 
373 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  27.36 
 
 
347 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  30.66 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  28.95 
 
 
320 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  29.61 
 
 
316 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  28.16 
 
 
456 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  28.49 
 
 
454 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  30.71 
 
 
321 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  28.85 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  29.8 
 
 
315 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  35.59 
 
 
315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  27.58 
 
 
416 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  27.58 
 
 
416 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  27.58 
 
 
416 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  37.37 
 
 
418 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  29.87 
 
 
322 aa  127  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  27.51 
 
 
379 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  27.99 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  27.75 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  28.75 
 
 
316 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  26.65 
 
 
439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  28.33 
 
 
315 aa  114  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  28.29 
 
 
412 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  28.75 
 
 
315 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  28.88 
 
 
328 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  29.68 
 
 
360 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  26.27 
 
 
363 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  26.49 
 
 
443 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  28.27 
 
 
319 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  29.54 
 
 
319 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  29.54 
 
 
319 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  29.19 
 
 
318 aa  104  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  33.5 
 
 
381 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  30.86 
 
 
314 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  25.55 
 
 
484 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  33 
 
 
313 aa  100  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  24.83 
 
 
498 aa  99.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  35.03 
 
 
314 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  27.48 
 
 
291 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  34.17 
 
 
314 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  32.84 
 
 
312 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  28.31 
 
 
337 aa  97.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  32.34 
 
 
312 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  26.18 
 
 
285 aa  96.7  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  25.99 
 
 
305 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  26.95 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  25.87 
 
 
285 aa  94.7  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  27.85 
 
 
393 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  27.27 
 
 
342 aa  94  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  27.9 
 
 
328 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  24.93 
 
 
300 aa  90.5  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  25.95 
 
 
305 aa  90.5  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  25.62 
 
 
329 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  30.3 
 
 
329 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  24.57 
 
 
303 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  25.31 
 
 
329 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  32.22 
 
 
303 aa  88.2  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  24.92 
 
 
339 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  24.44 
 
 
303 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  28.3 
 
 
336 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  26.02 
 
 
330 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  31.89 
 
 
304 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  26.25 
 
 
329 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  29.73 
 
 
299 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  26.25 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  31.89 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  27.99 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  32.83 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  30.27 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  25.94 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  27.96 
 
 
304 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  26.48 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  27.1 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  27.1 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  30.27 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  30.27 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>