More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl569 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl569  polypeptide deformylase  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00126694  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0206  polypeptide deformylase  61.42 
 
 		 200 aa  262  2e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3801  peptide deformylase  41.57 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3732  peptide deformylase  42.2 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3884  peptide deformylase  40.96 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3716  peptide deformylase  40.96 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  39.77 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4187  peptide deformylase  40.96 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3989  peptide deformylase  40.96 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4077  peptide deformylase  42.2 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4023  peptide deformylase  40.96 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4094  peptide deformylase  40.96 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1163  peptide deformylase  43.05 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1345  peptide deformylase  40.53 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.357445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  41.25 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0950  peptide deformylase  41.61 
 
 		 184 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000414865  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0522  peptide deformylase  33.87 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  37.37 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  38.86 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  38.86 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0510  peptide deformylase  33.87 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  42.21 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0806  peptide deformylase  42.41 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182352  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf699  formylmethionine deformylase  40 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1182  peptide deformylase  34.39 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0488263  normal  0.109178 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  36.47 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  35.29 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0581  peptide deformylase  33.33 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  37.93 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  34.75 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  33.9 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  33.9 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  33.9 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  33.9 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  33.9 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  33.9 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  34.75 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  33.9 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  33.9 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  34.75 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  33.9 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  34.75 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  33.9 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  33.05 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  33.87 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  33.05 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  33.05 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  33.05 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  33.05 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  33.05 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  33.05 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  34.21 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  32.14 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  33.93 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  31.9 
 
 		 170 aa  62  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  35 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  34.21 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  34.48 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  33.33 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  30.86 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  33.62 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  34.78 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  30.86 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  37.5 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  31.09 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  35.04 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  32.76 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  38.46 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  34.48 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  35.34 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  36.61 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  35.04 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  34.51 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  34.48 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  35.65 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  32.76 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  28.83 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  33.04 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  31.36 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  33.04 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  35.71 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  32.76 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  34.48 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  34.48 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  38.98 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  30.59 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  31.03 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  30.17 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1604  polypeptide deformylase  36.7 
 
 		 155 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000418701  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  38.98 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  34.75 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  38.53 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  29.41 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  29.41 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  34.17 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  36.52 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  36.94 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  35.25 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1885  polypeptide deformylase  36.7 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.366875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>