201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1723 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  100 
 
 		 459 aa  905    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  92.61 
 
 		 456 aa  835    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  95.86 
 
 		 455 aa  855    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  58.92 
 
 		 460 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  43.11 
 
 		 464 aa  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  47.12 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  48.67 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  42.41 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  47.47 
 
 		 442 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  48.77 
 
 		 437 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  40.5 
 
 		 438 aa  358  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  43.97 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  40.27 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  46.51 
 
 		 424 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  43.08 
 
 		 458 aa  307  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  41.62 
 
 		 379 aa  292  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  39.17 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  34.49 
 
 		 393 aa  206  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  38.34 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  35.98 
 
 		 399 aa  200  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  35.08 
 
 		 407 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  30.22 
 
 		 437 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  33.33 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  30.59 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  24.02 
 
 		 410 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  25.55 
 
 		 411 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  36.36 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  31.71 
 
 		 421 aa  149  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  30.08 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  24.57 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  25.06 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  32.42 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  32.61 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  25.06 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  29.84 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  31.97 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  30.96 
 
 		 431 aa  113  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  28.4 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.51 
 
 		 473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  26.65 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  27.44 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.01 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  31.87 
 
 		 370 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1683  Amidohydrolase 3  32.92 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  26.44 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  27.16 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  30.07 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  29.88 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  28.54 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  30.99 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  27.4 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  27.95 
 
 		 417 aa  106  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  30.85 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  28.87 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  28.64 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  29.3 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  30.22 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  30.72 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.12 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  29.67 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  29.41 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.06 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  28.19 
 
 		 436 aa  99.8  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  26.7 
 
 		 423 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  27.92 
 
 		 426 aa  99.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.82 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  27.54 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  27.54 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  27.54 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.84 
 
 		 411 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  28.16 
 
 		 418 aa  97.8  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  26.23 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  28.88 
 
 		 432 aa  96.7  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  30.19 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  27.29 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.84 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  29.92 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  27.29 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  27.29 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.09 
 
 		 413 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0955  cytosine deaminase  28.23 
 
 		 425 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366628  normal  0.0736723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  27.04 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  28.31 
 
 		 425 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.25 
 
 		 413 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  24.56 
 
 		 420 aa  93.2  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  24.56 
 
 		 420 aa  93.2  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.25 
 
 		 413 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.68 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.94 
 
 		 413 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.58 
 
 		 428 aa  91.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  28.17 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  28.93 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  29.11 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  27.96 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  27.84 
 
 		 424 aa  90.1  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  30.54 
 
 		 423 aa  90.1  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  28.29 
 
 		 423 aa  89.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  25.77 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  25.77 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  25.77 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>