68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2608 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 135 aa  267  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  73.08 
 
 		 138 aa  191  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  45.52 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  42.28 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  44.25 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  39.37 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  38.79 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  32.26 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  35.66 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  40.71 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  35.38 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  34.35 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  35.43 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  38.26 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  38.95 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  34.68 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2022  hypothetical protein  45.36 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  32.77 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  34.11 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  32 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  34.09 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  31.11 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  32.8 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  37.23 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  32.8 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  32.48 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  34.65 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  33.85 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  45.05 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  33.06 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  32.35 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  43.86 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  28.45 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  25.74 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  32 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  28.23 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  28.57 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  29.69 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  25.56 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  25.56 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  25.56 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2448  CopG domain protein DNA-binding domain protein  32.48 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  31.67 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  31.75 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  38.1 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  37.1 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  39.29 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  33.87 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  25.2 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  28.35 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  24 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  23.33 
 
 		 140 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  33.87 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  31.67 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  31.58 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  43.75 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  35.29 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>