More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0041 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
283 aa  585  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.85 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  54.88 
 
 
256 aa  265  7e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  48.19 
 
 
264 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  47.94 
 
 
309 aa  251  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
340 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
255 aa  243  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  48.33 
 
 
318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  47.43 
 
 
259 aa  236  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 
258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  46.94 
 
 
325 aa  233  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  48.78 
 
 
258 aa  229  5e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.16 
 
 
252 aa  229  5e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  45.02 
 
 
304 aa  229  5e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  46.34 
 
 
263 aa  223  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.72 
 
 
264 aa  221  9e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  45.49 
 
 
264 aa  214  9e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  44.23 
 
 
264 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
264 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  42.11 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  39.6 
 
 
263 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.65 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  37.45 
 
 
257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  38.58 
 
 
257 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.51 
 
 
258 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  37.65 
 
 
278 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  36.82 
 
 
280 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  39.26 
 
 
264 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.96 
 
 
249 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  33.6 
 
 
251 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  37.55 
 
 
257 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  35.57 
 
 
259 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  42.17 
 
 
248 aa  168  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.22 
 
 
253 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.99 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.99 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.99 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.06 
 
 
250 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.76 
 
 
276 aa  165  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.52 
 
 
279 aa  165  9e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  37.3 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40498  predicted protein  35.63 
 
 
311 aa  163  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.563879  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.66 
 
 
252 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  36.25 
 
 
253 aa  163  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.93 
 
 
267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  40 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  41.67 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  35.86 
 
 
253 aa  162  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  41.67 
 
 
253 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 
253 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  40.09 
 
 
252 aa  161  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 
253 aa  161  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 
253 aa  161  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 
253 aa  161  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  40.09 
 
 
253 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 
252 aa  161  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 
252 aa  161  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  38.59 
 
 
254 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  34.51 
 
 
255 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 
252 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  37.93 
 
 
261 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.24 
 
 
253 aa  160  2e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.83 
 
 
241 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  41.47 
 
 
252 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  41.95 
 
 
245 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.06 
 
 
257 aa  159  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  37.29 
 
 
256 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.57 
 
 
243 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  36.03 
 
 
262 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.03 
 
 
267 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.65 
 
 
252 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.65 
 
 
252 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.65 
 
 
252 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.39 
 
 
247 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.65 
 
 
252 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  40.65 
 
 
253 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.13 
 
 
233 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.08 
 
 
275 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  35.97 
 
 
253 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  37.76 
 
 
246 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  36.29 
 
 
262 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.18 
 
 
267 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  34.9 
 
 
253 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.06 
 
 
249 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 
264 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.78 
 
 
252 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  39.57 
 
 
239 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  37.92 
 
 
249 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  37.08 
 
 
275 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  37.92 
 
 
266 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88710  predicted protein  38.31 
 
 
273 aa  157  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0116194  decreased coverage  0.00230003 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  36.55 
 
 
275 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.14 
 
 
255 aa  156  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  36.55 
 
 
275 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  36.44 
 
 
240 aa  156  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.08 
 
 
275 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.08 
 
 
275 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  36.55 
 
 
275 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.19 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>