More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1734 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 410 aa  833    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  71.15 
 
 		 410 aa  587  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  66.83 
 
 		 409 aa  559  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  62.93 
 
 		 410 aa  520  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 408 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 409 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 377 aa  381  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 470 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 418 aa  306  6e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 418 aa  289  8e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 421 aa  226  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 431 aa  226  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 424 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 		 415 aa  213  5.999999999999999e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 434 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 426 aa  209  6e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 430 aa  209  6e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 421 aa  209  6e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 419 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  33.87 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 435 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 414 aa  206  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 423 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 423 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 		 417 aa  206  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 420 aa  205  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 		 421 aa  206  9e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 436 aa  203  6e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 419 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 421 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 445 aa  199  6e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 423 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 		 415 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 434 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 427 aa  195  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 		 424 aa  192  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 414 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl366  histidyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 419 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  32.41 
 
 		 422 aa  190  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 430 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 423 aa  189  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  31.81 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  31.75 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0324  histidyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 		 414 aa  186  6e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 424 aa  186  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 433 aa  186  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 426 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 420 aa  186  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>