More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1358 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
404 aa  825    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  36.65 
 
 
257 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.61 
 
 
426 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.79 
 
 
455 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.33 
 
 
455 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
521 aa  160  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
953 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
989 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
499 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
498 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
989 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  36.08 
 
 
603 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  34.14 
 
 
429 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  44.64 
 
 
474 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  43.29 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.92 
 
 
704 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
571 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  52.5 
 
 
636 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  34.14 
 
 
261 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  39.9 
 
 
263 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  50 
 
 
343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 
373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 
386 aa  129  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  52.1 
 
 
130 aa  130  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.16 
 
 
701 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  43.29 
 
 
340 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  32.22 
 
 
337 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.48 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  30.65 
 
 
273 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  52.94 
 
 
131 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.12 
 
 
355 aa  125  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  52.8 
 
 
135 aa  126  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  51.64 
 
 
143 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 
591 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 
352 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 
359 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 
377 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  31.34 
 
 
458 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  32.16 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  40.12 
 
 
255 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  38.73 
 
 
258 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  46.51 
 
 
316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  49.15 
 
 
429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  48.74 
 
 
238 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  36.87 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  44.6 
 
 
182 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
817 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
376 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  38.82 
 
 
469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  45.38 
 
 
450 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.98 
 
 
561 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
472 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  45.9 
 
 
667 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
126 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
384 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.14 
 
 
194 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.22 
 
 
245 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  43.44 
 
 
157 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
122 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 
249 aa  99  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  41.86 
 
 
311 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  41.27 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
127 aa  98.6  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.44 
 
 
461 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.74 
 
 
701 aa  97.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 
122 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  30.96 
 
 
248 aa  96.3  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.37 
 
 
199 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.22 
 
 
457 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  38.81 
 
 
134 aa  93.2  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  41.03 
 
 
134 aa  92.8  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01100  sensory box/GGDEF family protein  32.69 
 
 
798 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.68 
 
 
199 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.18 
 
 
471 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  27.39 
 
 
387 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.34 
 
 
196 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
612 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.32 
 
 
194 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.34 
 
 
196 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6068  response regulator receiver protein  34.94 
 
 
248 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.85 
 
 
197 aa  87  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  38.33 
 
 
197 aa  87  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  38.33 
 
 
204 aa  87  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.03 
 
 
635 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.03 
 
 
481 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.13 
 
 
200 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  28.64 
 
 
408 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.14 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  36.67 
 
 
207 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.93 
 
 
202 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.44 
 
 
210 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  36.67 
 
 
199 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.44 
 
 
210 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.44 
 
 
210 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  37.07 
 
 
191 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  37.61 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  36.44 
 
 
189 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>