80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2369 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  71.43 
 
 		 70 aa  114  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  59.42 
 
 		 69 aa  98.6  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  58.82 
 
 		 75 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  57.97 
 
 		 74 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  55.22 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  57.35 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  58.46 
 
 		 68 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  55.38 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  59.68 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  52.94 
 
 		 70 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  45.83 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  54.55 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  51.72 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  46.88 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  43.48 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  48.28 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  41.33 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  38.89 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1629  hypothetical protein  41.54 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  41.38 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  38.6 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  41.82 
 
 		 72 aa  52  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  43.48 
 
 		 67 aa  52  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  53.66 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  33.82 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  38.18 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  43.75 
 
 		 56 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0592  hypothetical protein  44.9 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  35.19 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  41.51 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  47.73 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  37.14 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  30.14 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  31.51 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  32.84 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  32.84 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  33.82 
 
 		 71 aa  43.5  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  35.48 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  41.18 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  33.87 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  32.76 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1106  hypothetical protein  45.24 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  37.88 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  32.08 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  37.88 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  32.2 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  32.08 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  32.08 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  31.34 
 
 		 69 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  34.38 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  33.93 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  33.93 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  40.74 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  32.31 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  32.86 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  39.68 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  40.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  31.25 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  35.85 
 
 		 135 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  32.73 
 
 		 68 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  32.73 
 
 		 68 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2967  hypothetical protein  35.42 
 
 		 64 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.436183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>