114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1966 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1966  flagellar accessory protein FlaH  100 
 
 		 262 aa  522  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1343  flagellar accessory protein FlaH  44.25 
 
 		 244 aa  216  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0124869  normal  0.27777 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0950  flagellar accessory protein FlaH  41.04 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0103  flagellar accessory protein FlaH  40.79 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0351  flagellar accessory protein FlaH  43.03 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1863  flagellar accessory protein FlaH  42.98 
 
 		 244 aa  198  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0129  flagellar accessory protein FlaH  32.31 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1326  flagellar accessory protein FlaH  30.57 
 
 		 227 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0186854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1573  ATPase  26.94 
 
 		 231 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1319  AAA ATPase  27.43 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0347852  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0231  flagella-related protein H  25.32 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0947  flagellar accessory protein FlaH  26.01 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.316996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0998  flagellar accessory protein FlaH  26.46 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.753436  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2567  AAA ATPase  22.75 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0974  flagellar accessory protein FlaH  27.11 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.281333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1733  flagellar accessory protein FlaH  26.01 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0959  flagella-related protein H  22.36 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2873  AAA ATPase  22.55 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.859778  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0266  flagellar accessory protein FlaH  23.39 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.381064  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3413  ATPase involved in biogenesis of flagella-like protein  20.17 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  28.57 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  25.65 
 
 		 494 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  24.23 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3108  hypothetical protein  27.66 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10072  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  23.35 
 
 		 519 aa  58.9  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  24.89 
 
 		 496 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  22.47 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  23.14 
 
 		 504 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  22.84 
 
 		 521 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  22.84 
 
 		 521 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  35.53 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  24.46 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  24.46 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  25 
 
 		 520 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  25.73 
 
 		 498 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  22.47 
 
 		 519 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  21.46 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  24.39 
 
 		 509 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  23.72 
 
 		 510 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  21.03 
 
 		 492 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  23.35 
 
 		 514 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  34.62 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  23.35 
 
 		 500 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  23.9 
 
 		 509 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  23.04 
 
 		 492 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  23.35 
 
 		 500 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  25.24 
 
 		 509 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  28.99 
 
 		 460 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0710  hypothetical protein  29.75 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000127893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  29.66 
 
 		 507 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  29.66 
 
 		 507 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  23.83 
 
 		 519 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  21.59 
 
 		 512 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  22.36 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  22.36 
 
 		 510 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  22.69 
 
 		 514 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  24.26 
 
 		 498 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  21.46 
 
 		 488 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  24.55 
 
 		 467 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  22.84 
 
 		 528 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  24.27 
 
 		 501 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  23.26 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 		 494 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  21.54 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  29.66 
 
 		 506 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  28.89 
 
 		 461 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  27.33 
 
 		 454 aa  49.3  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  21.43 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  30.77 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  20.95 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4000  DNA repair protein RadA  31.47 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405173  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  23.03 
 
 		 501 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4095  DNA repair protein RadA  29.94 
 
 		 452 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  30.77 
 
 		 454 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  30.77 
 
 		 454 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  33.33 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  26.56 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  24.28 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  23.98 
 
 		 509 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  22.56 
 
 		 500 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 497 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  21.92 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  20.48 
 
 		 281 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  24.64 
 
 		 502 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  21.6 
 
 		 518 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0879  KaiC  27.46 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1993  putative circadian clock protein, KaiC  28.99 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  22.27 
 
 		 567 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.5 
 
 		 504 aa  45.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  28.85 
 
 		 456 aa  45.4  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  27.7 
 
 		 458 aa  45.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  27.41 
 
 		 457 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 		 461 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  20.67 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  19.52 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1443  DNA repair protein RadA  31.37 
 
 		 454 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  27.63 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  27.39 
 
 		 451 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.15 
 
 		 498 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01521  DNA repair protein RadA  31.25 
 
 		 450 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.268386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>