More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2504 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
309 aa  626  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  37.08 
 
 
296 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  36.86 
 
 
308 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  35.23 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  36.44 
 
 
301 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  36.07 
 
 
322 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 
313 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  35.4 
 
 
317 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  36.84 
 
 
321 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  35.96 
 
 
321 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  34.67 
 
 
324 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  34.86 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  34.27 
 
 
315 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  32.06 
 
 
290 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  31.93 
 
 
289 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  29.72 
 
 
289 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  33.46 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 
297 aa  135  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  31.85 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  29.17 
 
 
289 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 
289 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 
289 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 
289 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  30.31 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  31.7 
 
 
289 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 
290 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 
290 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 
290 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  32.84 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  29.81 
 
 
287 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  27.61 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  31.58 
 
 
304 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  29.72 
 
 
294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  27.92 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  28.33 
 
 
293 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  29.9 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  25.83 
 
 
339 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  26.94 
 
 
294 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  29.66 
 
 
303 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  26.6 
 
 
294 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  29.14 
 
 
280 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  29.86 
 
 
292 aa  99.4  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  25.81 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  21.58 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  24.48 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 
544 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 
543 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.62 
 
 
542 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  34.83 
 
 
498 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
224 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  29.41 
 
 
268 aa  62.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
224 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  33.96 
 
 
210 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  33.96 
 
 
210 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
215 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.65 
 
 
707 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  33.62 
 
 
122 aa  59.3  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  28.85 
 
 
670 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  33.64 
 
 
231 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 
239 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 
220 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  35.58 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0261  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 
201 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836799  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 
218 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 
230 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.83 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  31.13 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 
230 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  31.46 
 
 
510 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.65 
 
 
220 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 
230 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2529  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 
216 aa  57  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.718036 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  35.35 
 
 
321 aa  56.6  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  32.38 
 
 
229 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  33.91 
 
 
703 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 
221 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  32.38 
 
 
229 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 
221 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  37.86 
 
 
221 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  35.79 
 
 
363 aa  55.8  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  40.85 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  34.95 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 
533 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1913  OmpA/MotB  36.27 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467087  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  37.61 
 
 
402 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  39.19 
 
 
481 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 
221 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 
230 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  29.75 
 
 
525 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3525  OmpA/MotB domain-containing protein  38.2 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  32.08 
 
 
451 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 
239 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  34.82 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  31.31 
 
 
694 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>