285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0564 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  55.67 
 
 		 292 aa  362  3e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  55.59 
 
 		 292 aa  361  9e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  54.98 
 
 		 292 aa  359  2e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  54.98 
 
 		 292 aa  359  3e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  34.38 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.21 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.22 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  38.73 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  36.13 
 
 		 292 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  33.6 
 
 		 307 aa  148  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  37.19 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  31.8 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  34.08 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  34.65 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.31 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.1 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  29.93 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.62 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.2 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.22 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.24 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.47 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  28.01 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.38 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.43 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.92 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  33.5 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.3 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.11 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.06 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.79 
 
 		 293 aa  118  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.23 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  34.31 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  29.03 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  31.15 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  29.93 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  29.17 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.43 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.82 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.86 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.36 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.16 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.37 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.84 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  28.69 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  28.69 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.05 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.92 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.33 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  24.83 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.83 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.43 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.81 
 
 		 314 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.67 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.43 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.43 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.65 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.17 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1657  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.48 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.161868  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.55 
 
 		 344 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.17 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  30.24 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  28 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  28 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  25.33 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  29.2 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  28 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.13 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  28 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  28 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  28 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  28.27 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  27.56 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.03 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  27.56 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.15 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  30.58 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.85 
 
 		 294 aa  99  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  26.77 
 
 		 308 aa  99  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.95 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  29.07 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  23.51 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  29.82 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  27.31 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.21 
 
 		 300 aa  96.3  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.15 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  28.33 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  28.33 
 
 		 301 aa  95.5  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  31.85 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  27.75 
 
 		 329 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  32.7 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.57 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  32.38 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  32.08 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  32.54 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.48 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.57 
 
 		 327 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>