More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0313 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0313  hflK protein, putative  100 
 
 		 329 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  60.2 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  47.77 
 
 		 350 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  47.77 
 
 		 350 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  50.35 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  42.95 
 
 		 350 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  42.77 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1332  hflK protein, putative  40.94 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.683912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0545  HflK protein  40.85 
 
 		 366 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000873771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  36.28 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  37.97 
 
 		 407 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  36.13 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  36.77 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  36.57 
 
 		 395 aa  188  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  36.3 
 
 		 378 aa  188  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  35.64 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0205  HflK protein  36.96 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  34.27 
 
 		 367 aa  182  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  36.25 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  38.74 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  35.54 
 
 		 359 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  35.93 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  33.44 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  36.92 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  36.91 
 
 		 383 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  31.23 
 
 		 344 aa  176  6e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  35.24 
 
 		 389 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  36.84 
 
 		 376 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  35.67 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  34.03 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  36.3 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  36.56 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  36.3 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  36.12 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36.77 
 
 		 378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  33.75 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  36.28 
 
 		 390 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  35.9 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  35.27 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  37.13 
 
 		 413 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  34.97 
 
 		 433 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  34.05 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  35.27 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  35 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  33.9 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  35 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  34.28 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  35.93 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  36.76 
 
 		 385 aa  169  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  34.92 
 
 		 391 aa  169  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  36.55 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  34.87 
 
 		 389 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  35.59 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  32.78 
 
 		 503 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  35.18 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  35.16 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  34.07 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  36.91 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  35.34 
 
 		 419 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  35.34 
 
 		 419 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  35.34 
 
 		 419 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  35.34 
 
 		 419 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  34.63 
 
 		 421 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  35.34 
 
 		 419 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  35.02 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  32.34 
 
 		 498 aa  165  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  35.35 
 
 		 394 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  35.74 
 
 		 393 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3917  FtsH protease regulator HflK  35.79 
 
 		 415 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02636  integral membrane protease subunit  35.43 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  33.82 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  34.54 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  33.44 
 
 		 351 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0003  HflK protein  37 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  36.33 
 
 		 393 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  36.04 
 
 		 420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  36.36 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  34.11 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  34.44 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  35.05 
 
 		 405 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  35.05 
 
 		 393 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  35.71 
 
 		 382 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  34.11 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  34.34 
 
 		 401 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  36.3 
 
 		 381 aa  162  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  35.64 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  35.92 
 
 		 360 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  34.03 
 
 		 331 aa  162  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  34.54 
 
 		 401 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  32.25 
 
 		 447 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  34.59 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  34.19 
 
 		 418 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3822  HflK protein  35.21 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0972078  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  34.14 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  33.1 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  35.1 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  33.02 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  35.03 
 
 		 475 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  34.68 
 
 		 399 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  33.44 
 
 		 383 aa  159  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>