286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02498 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 411 aa  850    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  60.78 
 
 		 408 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  53.98 
 
 		 408 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  48.61 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  49.87 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  50.88 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  49.13 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.75 
 
 		 424 aa  360  4e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  45.3 
 
 		 427 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  45.05 
 
 		 427 aa  359  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  46.4 
 
 		 411 aa  356  5e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  44.8 
 
 		 427 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  46.06 
 
 		 431 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  43.86 
 
 		 420 aa  349  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  48.37 
 
 		 416 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  41.79 
 
 		 415 aa  338  9e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  40.89 
 
 		 415 aa  329  4e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  42.75 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  44.33 
 
 		 424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  45.87 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.04 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  44.23 
 
 		 418 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  42.54 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  40.59 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.88 
 
 		 416 aa  295  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  38.12 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  41.35 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  41.32 
 
 		 591 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  38.2 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  39.95 
 
 		 420 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  39.2 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  37.66 
 
 		 409 aa  278  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.42 
 
 		 593 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  38.18 
 
 		 419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.41 
 
 		 599 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.73 
 
 		 589 aa  270  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  38.95 
 
 		 591 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.73 
 
 		 589 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  37.53 
 
 		 425 aa  265  8.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40 
 
 		 594 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.66 
 
 		 592 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.37 
 
 		 599 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.11 
 
 		 592 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  36.21 
 
 		 430 aa  249  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.98 
 
 		 412 aa  247  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  35.62 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.16 
 
 		 592 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  34.72 
 
 		 411 aa  232  9e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.24 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.32 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  31.92 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  37.13 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  35.47 
 
 		 419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 413 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  34.02 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  32.75 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  33.01 
 
 		 437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  34.73 
 
 		 416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  33.06 
 
 		 424 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.82 
 
 		 418 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  33.68 
 
 		 423 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  36.66 
 
 		 422 aa  212  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  35.95 
 
 		 479 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.7 
 
 		 415 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  34.88 
 
 		 412 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  34.22 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 		 428 aa  209  8e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.73 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.8 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.82 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  33.67 
 
 		 431 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  36.5 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  36.5 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  32.68 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  34.97 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  34.1 
 
 		 427 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  33.92 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  33.92 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  36.25 
 
 		 471 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  33.92 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  33.92 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  33.84 
 
 		 427 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  34.16 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  32.81 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  34.16 
 
 		 416 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  34.47 
 
 		 427 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  34.19 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  33 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.05 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.55 
 
 		 430 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  33.91 
 
 		 427 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.5 
 
 		 419 aa  201  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  33 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  34.65 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  34.65 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.82 
 
 		 428 aa  200  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.07 
 
 		 447 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  34.95 
 
 		 459 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>