227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6676 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  100 
 
 		 388 aa  718    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  88.14 
 
 		 388 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  65.44 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  65.07 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  66.29 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  68.47 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  57.1 
 
 		 388 aa  346  5e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  43.98 
 
 		 394 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  47.84 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  45.95 
 
 		 394 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  45.88 
 
 		 413 aa  295  8e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  45.68 
 
 		 394 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  47.14 
 
 		 380 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  48.29 
 
 		 380 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  48 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  46.2 
 
 		 375 aa  252  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 392 aa  186  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 402 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 381 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 393 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  34.48 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  33.81 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 386 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 386 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  35.43 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  32.94 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  32.94 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  32.94 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  32.94 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 386 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 409 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  32.28 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  30.64 
 
 		 379 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 379 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  32.54 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  32.41 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 385 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 385 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 447 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  33.08 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  31.95 
 
 		 393 aa  100  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  25.75 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 428 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  25.97 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  25.45 
 
 		 398 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  25.45 
 
 		 398 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  25.45 
 
 		 398 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  26.1 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 433 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  30.88 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  26.42 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 418 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0357  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  25.47 
 
 		 520 aa  87.8  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 432 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 431 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  27.37 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  27.5 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>