More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6212 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  100 
 
 		 177 aa  340  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  81.36 
 
 		 196 aa  277  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  45.51 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  43.1 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  42.53 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  42.77 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  61.06 
 
 		 130 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  57.39 
 
 		 128 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 124 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  53.97 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  53.98 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  53.98 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  52.99 
 
 		 129 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  50.44 
 
 		 129 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 151 aa  99  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 134 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  40.5 
 
 		 134 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 134 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 131 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 123 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  41.18 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  37.38 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  39.2 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  36.59 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  40.54 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 688 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1735  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  32.52 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  34.17 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  40.71 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 		 1067 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 655 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 743 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  39.22 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  37.07 
 
 		 761 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 		 696 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.96 
 
 		 650 aa  71.6  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  29.82 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  31.3 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 727 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  36.64 
 
 		 754 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  31.45 
 
 		 533 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 727 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  31.45 
 
 		 533 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 124 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 1036 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  42.57 
 
 		 126 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 136 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2991  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 727 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 926 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  36.36 
 
 		 812 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 926 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  32.48 
 
 		 531 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 548 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  32.76 
 
 		 507 aa  65.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  34.13 
 
 		 573 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 732 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 		 926 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 936 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 769 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 773 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 821 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 789 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 630 aa  64.7  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 740 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  39.33 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  31.65 
 
 		 845 aa  64.3  0.0000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  31.67 
 
 		 537 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  33.64 
 
 		 695 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 1651 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 695 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 1646 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 1193 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  36.27 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 741 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 1631 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>