95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5629 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  287  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  64.86 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  64.86 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  64.86 
 
 		 138 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  64.55 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  50 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  63.96 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.44 
 
 		 139 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.39 
 
 		 143 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  48.18 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.98 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  54.95 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.29 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  53.4 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  53.21 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  44.14 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  50.37 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.26 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  49.06 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  49.06 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  49.06 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  46.15 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  55.1 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  42.03 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.61 
 
 		 179 aa  97.1  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.04 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  49.06 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  49.04 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  49.04 
 
 		 318 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.28 
 
 		 138 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  48.78 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  44.95 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  45.19 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  47.12 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.31 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.67 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.67 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  52.17 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.62 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  41.38 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.23 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.62 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  37.74 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.79 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  34.31 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.06 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  34.85 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  35.85 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  33.91 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  38.95 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  32.12 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  35.85 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  36.89 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  31.39 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  33.91 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  30.58 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  35.85 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  42.22 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.37 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  33.7 
 
 		 150 aa  50.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  36.19 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 		 231 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  27.61 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  31.88 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.293758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4298  cupin 2 domain-containing protein  32.32 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  35.29 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6217  cupin 2, barrel  30 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  37.89 
 
 		 111 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  36.92 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  36.92 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  36.92 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0499  cupin domain-containing protein  36.92 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  38.46 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  36.92 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  36.92 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  36.92 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.2 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>