More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1933 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  100 
 
 		 299 aa  584  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  69.26 
 
 		 292 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  66.9 
 
 		 289 aa  388  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  67.64 
 
 		 292 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  63.03 
 
 		 284 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  56.89 
 
 		 287 aa  329  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  58.16 
 
 		 287 aa  328  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  45.22 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  45.59 
 
 		 287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  45.22 
 
 		 284 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  45.22 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  45.45 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.82 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  42.2 
 
 		 287 aa  235  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  40.74 
 
 		 288 aa  232  5e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  48 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  44.68 
 
 		 287 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  44.81 
 
 		 282 aa  228  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  45.35 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  44.91 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  45.67 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  41.13 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  41.13 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  48.69 
 
 		 295 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  43.12 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  43.1 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  45.33 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.07 
 
 		 292 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  43.49 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  47.01 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  44.53 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  43.95 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  46.35 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  42.86 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  42.09 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  41.24 
 
 		 291 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  43.7 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  40.29 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  43.33 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  37.96 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  40.38 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0283  putative methylisocitrate lyase  43.17 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.548186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  41.76 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  40.38 
 
 		 296 aa  195  6e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  39.03 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  38.08 
 
 		 292 aa  195  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  41.11 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  37.59 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  42.91 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  38.08 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  38.41 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.29 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  37.82 
 
 		 287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  38.08 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  39.66 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4791  2,3-dimethylmalate lyase  43.61 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  38.6 
 
 		 292 aa  189  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  38.6 
 
 		 292 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2320  2,3-dimethylmalate lyase  40.27 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0895569  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  38.6 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  37.31 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  38.24 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  37.31 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0952  2-methylisocitrate lyase  37.26 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  39.86 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2648  methylisocitrate lyase  43.97 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.843725  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02397  2-methylisocitrate lyase  37.12 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  37.55 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  38.7 
 
 		 292 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  38.7 
 
 		 292 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  36.5 
 
 		 292 aa  185  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  38.7 
 
 		 292 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  38.7 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  38.7 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  37.12 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  40.74 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  42.97 
 
 		 302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  37.15 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3510  methylisocitrate lyase  43.3 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.120815  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  39.59 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  36.54 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  42.57 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  42.57 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.57 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  42.91 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  35.42 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  42.57 
 
 		 302 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.57 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.57 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  42.57 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  37.64 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1831  2-methylisocitrate lyase  37.63 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464615 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  37.64 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  37.45 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0622  methylisocitrate lyase  43.57 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  39.6 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  42.57 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2155  2-methylisocitrate lyase  37.99 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0650  methylisocitrate lyase  43.96 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  37.31 
 
 		 293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>