153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1031 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  100 
 
 
295 aa  589  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  88.58 
 
 
291 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  74.65 
 
 
289 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  73.76 
 
 
300 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  57.79 
 
 
300 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  55.35 
 
 
289 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  55.35 
 
 
275 aa  297  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  54.98 
 
 
289 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  48.3 
 
 
286 aa  238  9e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  44.76 
 
 
289 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  40.42 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  39.44 
 
 
306 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  40.07 
 
 
287 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  41.52 
 
 
296 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  42.28 
 
 
309 aa  198  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  41.54 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  41.04 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  40.7 
 
 
290 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  41.03 
 
 
312 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  39.16 
 
 
320 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  36.82 
 
 
323 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  39.08 
 
 
286 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  38.19 
 
 
294 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  39.18 
 
 
289 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  38.73 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  41.22 
 
 
302 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  33.91 
 
 
302 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  41.33 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  36.3 
 
 
304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
310 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
310 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
310 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  35.59 
 
 
305 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
325 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  35.23 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  35.64 
 
 
283 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  34.88 
 
 
327 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  37.23 
 
 
290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  34.52 
 
 
304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  33.1 
 
 
313 aa  165  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  35.23 
 
 
295 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  34.52 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
302 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  34.41 
 
 
312 aa  162  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  34.04 
 
 
314 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
310 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  34.2 
 
 
290 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  35.64 
 
 
305 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  40.43 
 
 
290 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  42.75 
 
 
298 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  33.1 
 
 
302 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  34.64 
 
 
307 aa  155  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  32.86 
 
 
290 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  36.03 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  36.9 
 
 
297 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  40.22 
 
 
290 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  36.94 
 
 
274 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  35.79 
 
 
279 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  40.22 
 
 
303 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  34.42 
 
 
321 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  37.87 
 
 
306 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  37.87 
 
 
306 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  39.5 
 
 
285 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  36.96 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  34.14 
 
 
295 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  37.18 
 
 
273 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  38.32 
 
 
315 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  36.26 
 
 
296 aa  145  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  32.71 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  37.23 
 
 
308 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  35.21 
 
 
271 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  35.62 
 
 
295 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  34.46 
 
 
271 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  37.64 
 
 
297 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  36.43 
 
 
293 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  36.76 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  36.92 
 
 
368 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  36.92 
 
 
324 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  36.92 
 
 
327 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  36.92 
 
 
330 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  38.89 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  36.43 
 
 
293 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  36.43 
 
 
293 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  36.92 
 
 
330 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  36.92 
 
 
330 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  36.92 
 
 
330 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  37.14 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  35.53 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  38.83 
 
 
302 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  37.41 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  37.04 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  36.73 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  35.19 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  37.04 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  37.04 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  37.31 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  37.04 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  37.41 
 
 
308 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>