More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0711 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0711  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  239  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 688 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  35.19 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  32.17 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  36.28 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  34.43 
 
 		 580 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  34.43 
 
 		 685 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  33.61 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  38 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  36.89 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  38.74 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  32.74 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  32.52 
 
 		 858 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1603  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  0.483504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  29.2 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 628 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  37 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5761  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 708 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  32.26 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  31.86 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  32.76 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2995  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 951 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 688 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 703 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1067 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3762  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.198596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 688 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2141  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217748  hitchhiker  0.000119554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 1651 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  41.77 
 
 		 416 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 1631 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  37.86 
 
 		 676 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  32 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 622 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  33.08 
 
 		 280 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0074  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.675697  hitchhiker  0.00113108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  36 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  30.51 
 
 		 622 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2204  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 588 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0313534  normal  0.331001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 1105 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 622 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 		 1057 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3743  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 811 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2519  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  43.27 
 
 		 468 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2001  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002906 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2901  nitrogen regulation protein NR(I)  43.27 
 
 		 468 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  33.59 
 
 		 556 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 641 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 696 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 520 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1361  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 459 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  33.88 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  35 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 557 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 686 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21073  normal  0.829403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 890 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  29.82 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 641 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  30.71 
 
 		 1036 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  27.68 
 
 		 695 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2310  sigma-54 dependent response regulator  30.89 
 
 		 478 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 		 695 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 1036 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 		 573 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 1646 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  29.25 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2105  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 651 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 887 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 		 732 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  36.54 
 
 		 537 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5184  response regulator receiver domain-containing protein  45.61 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546005  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 559 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  33 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 810 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  33.93 
 
 		 529 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>